MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 plasmid A

Total Repeats: 775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007483	CG	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007483	CT	3	6	26	31	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007483	TCTT	2	8	37	44	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007483	AGAGG	2	10	84	93	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007483	TGC	2	6	95	100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007483	GTT	3	9	159	167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007483	ATG	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007483	C	6	6	256	261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_007483	GTG	2	6	371	376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163518
10	NC_007483	GCC	2	6	477	482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163518
11	NC_007483	TCCTGC	2	12	563	574	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77163518
12	NC_007483	TCC	2	6	629	634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163518
13	NC_007483	GCC	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163518
14	NC_007483	CAT	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163518
15	NC_007483	CCA	2	6	825	830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163518
16	NC_007483	GTA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163518
17	NC_007483	TGCT	2	8	869	876	0 %	50 %	25 %	25 %	77163518
18	NC_007483	TCGG	2	8	886	893	0 %	25 %	50 %	25 %	77163518
19	NC_007483	CTC	2	6	910	915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163518
20	NC_007483	GCC	2	6	1180	1185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163519
21	NC_007483	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163519
22	NC_007483	TCA	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163519
23	NC_007483	CCT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163519
24	NC_007483	ATAC	2	8	1421	1428	50 %	25 %	0 %	25 %	77163519
25	NC_007483	GCC	2	6	1468	1473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163519
26	NC_007483	CAGC	2	8	1519	1526	25 %	0 %	25 %	50 %	77163519
27	NC_007483	CCT	3	9	1574	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163519
28	NC_007483	TTG	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163519
29	NC_007483	GTT	2	6	1592	1597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163519
30	NC_007483	TAG	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007483	AAAG	2	8	1706	1713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007483	GCTCT	2	10	1762	1771	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007483	TCA	2	6	1772	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007483	ATTA	2	8	1789	1796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007483	CTC	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007483	AT	3	6	1993	1998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007483	AAGA	2	8	2055	2062	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007483	AT	3	6	2101	2106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007483	CAA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007483	AATC	2	8	2134	2141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007483	CCA	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163520
42	NC_007483	TTCC	2	8	2419	2426	0 %	50 %	0 %	50 %	77163520
43	NC_007483	GCCA	2	8	2505	2512	25 %	0 %	25 %	50 %	77163520
44	NC_007483	AATTT	2	10	2556	2565	40 %	60 %	0 %	0 %	77163520
45	NC_007483	CT	3	6	2572	2577	0 %	50 %	0 %	50 %	77163521
46	NC_007483	TCTTA	2	10	2586	2595	20 %	60 %	0 %	20 %	77163521
47	NC_007483	CCT	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163522
48	NC_007483	CCAGA	2	10	2875	2884	40 %	0 %	20 %	40 %	77163522
49	NC_007483	CGG	2	6	2925	2930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
50	NC_007483	AAC	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163522
51	NC_007483	CG	3	6	3014	3019	0 %	0 %	50 %	50 %	77163522
52	NC_007483	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	77163522
53	NC_007483	ACC	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
54	NC_007483	ACT	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163522
55	NC_007483	GAA	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163522
56	NC_007483	ACC	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
57	NC_007483	ACC	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
58	NC_007483	CGG	2	6	3234	3239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
59	NC_007483	GGC	2	6	3255	3260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
60	NC_007483	GCA	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
61	NC_007483	GCA	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
62	NC_007483	GCA	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
63	NC_007483	ACC	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
64	NC_007483	AGC	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
65	NC_007483	GCCA	2	8	3351	3358	25 %	0 %	25 %	50 %	77163522
66	NC_007483	GGC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
67	NC_007483	AGCG	2	8	3406	3413	25 %	0 %	50 %	25 %	77163522
68	NC_007483	CGCCAC	2	12	3420	3431	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	77163522
69	NC_007483	GGCGA	2	10	3499	3508	20 %	0 %	60 %	20 %	77163522
70	NC_007483	AC	3	6	3643	3648	50 %	0 %	0 %	50 %	77163522
71	NC_007483	AACA	2	8	3674	3681	75 %	0 %	0 %	25 %	77163522
72	NC_007483	ACC	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
73	NC_007483	CACGC	2	10	3724	3733	20 %	0 %	20 %	60 %	77163522
74	NC_007483	GAA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163522
75	NC_007483	GAAAC	2	10	3795	3804	60 %	0 %	20 %	20 %	77163522
76	NC_007483	AAC	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163522
77	NC_007483	AGG	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163522
78	NC_007483	GC	3	6	3900	3905	0 %	0 %	50 %	50 %	77163522
79	NC_007483	CGG	2	6	3913	3918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
80	NC_007483	G	6	6	3920	3925	0 %	0 %	100 %	0 %	77163522
81	NC_007483	CGG	2	6	3927	3932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
82	NC_007483	GCAA	2	8	3963	3970	50 %	0 %	25 %	25 %	77163522
83	NC_007483	GCC	2	6	3999	4004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163522
84	NC_007483	GCC	2	6	4028	4033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_007483	CAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007483	GCC	2	6	4068	4073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007483	CGC	2	6	4102	4107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007483	CCG	2	6	4136	4141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007483	AGCAC	2	10	4149	4158	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_007483	GCGCC	2	10	4220	4229	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_007483	ACG	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007483	AGA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007483	ATTT	2	8	4468	4475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007483	ATG	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007483	GA	3	6	4530	4535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007483	ACT	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163523
97	NC_007483	GAA	2	6	4679	4684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163523
98	NC_007483	CGC	2	6	4736	4741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163523
99	NC_007483	ATA	2	6	4913	4918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163524
100	NC_007483	TGC	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163524
101	NC_007483	CCT	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163524
102	NC_007483	AGC	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163524
103	NC_007483	CTG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163524
104	NC_007483	GGAG	2	8	5102	5109	25 %	0 %	75 %	0 %	77163524
105	NC_007483	TGA	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163524
106	NC_007483	TACTC	2	10	5176	5185	20 %	40 %	0 %	40 %	77163524
107	NC_007483	GAG	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163524
108	NC_007483	TTC	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007483	CCG	2	6	5490	5495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
110	NC_007483	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163525
111	NC_007483	AAT	2	6	5768	5773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
112	NC_007483	CAC	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163525
113	NC_007483	AGCT	2	8	5900	5907	25 %	25 %	25 %	25 %	77163525
114	NC_007483	CGAT	2	8	5937	5944	25 %	25 %	25 %	25 %	77163525
115	NC_007483	CGGT	2	8	5972	5979	0 %	25 %	50 %	25 %	77163525
116	NC_007483	ACC	2	6	6123	6128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163525
117	NC_007483	TCA	2	6	6171	6176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163525
118	NC_007483	GCT	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163525
119	NC_007483	TCTG	2	8	6264	6271	0 %	50 %	25 %	25 %	77163525
120	NC_007483	TGC	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163525
121	NC_007483	GCC	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
122	NC_007483	CTT	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163525
123	NC_007483	CCT	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163525
124	NC_007483	CCG	2	6	6532	6537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
125	NC_007483	AGAAAA	2	12	6627	6638	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	77163525
126	NC_007483	A	6	6	6635	6640	100 %	0 %	0 %	0 %	77163525
127	NC_007483	TAA	2	6	6647	6652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
128	NC_007483	ATA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
129	NC_007483	CTC	2	6	6673	6678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007483	TA	3	6	6744	6749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007483	AG	3	6	6752	6757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007483	AG	3	6	6774	6779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007483	AAG	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007483	AAC	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163526
135	NC_007483	CAG	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163526
136	NC_007483	CAG	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163526
137	NC_007483	GCT	2	6	6985	6990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163526
138	NC_007483	GTC	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163526
139	NC_007483	AG	3	6	7110	7115	50 %	0 %	50 %	0 %	77163526
140	NC_007483	GCTGA	2	10	7144	7153	20 %	20 %	40 %	20 %	77163526
141	NC_007483	CTC	2	6	7157	7162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163526
142	NC_007483	CCT	3	9	7178	7186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163526
143	NC_007483	CGC	2	6	7197	7202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163526
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188	NC_007483	TCA	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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262	NC_007483	TAA	2	6	13498	13503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163533
263	NC_007483	TCG	2	6	13509	13514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163533
264	NC_007483	ATG	2	6	13541	13546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163533
265	NC_007483	T	7	7	13549	13555	0 %	100 %	0 %	0 %	77163533
266	NC_007483	GTA	2	6	13601	13606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_007483	AGG	2	6	13658	13663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
268	NC_007483	CTT	2	6	13686	13691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_007483	AC	3	6	13704	13709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
270	NC_007483	TTAAT	2	10	13710	13719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_007483	A	6	6	13751	13756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_007483	ATT	2	6	13774	13779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_007483	CAC	2	6	13780	13785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_007483	TATC	2	8	13832	13839	25 %	50 %	0 %	25 %	77163534
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276	NC_007483	GTT	2	6	13923	13928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163534
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